YeastsModels
酵母代谢网络模型集
多物种酵母基因组尺度代谢网络模型的整合仓库，统一格式便于比较分析
Curated collection of genome-scale metabolic models for multiple yeast species
Systems Biology Metabolic Modeling Bioinformatics SBML HTML
在 GitHub 查看 ↗ 2026年6月8日
收录并整理了多种酵母的全基因组尺度代谢网络模型（Genome-Scale Metabolic Model, GEM），统一模型格式，便于研究者直接用于代谢通量分析（FBA）和跨物种比较研究。
收录内容
- 毕赤酵母（Pichia pastoris）、酿酒酵母（S. cerevisiae）等工业常用菌株
- 标准化 SBML 格式，兼容主流代谢建模工具
- 附带基本代谢通量分析（FBA）示例脚本
应用场景
代谢网络模型是菌株改造与工艺优化的核心工具。通过模型计算，可在计算层面预测基因敲除/过表达对代谢通量的影响，指导发酵工艺设计。
Tech Stack
SBML · COBRApy · HTML